淮南师范学院马克思主义学院承担着全校思想政治教育专业和思想政治理论课教学与管理的任务，其前身是学校最早设置的教学单位之一。
1978年学校恢复办学后，在原马列教研室的基础上，于1984年2月设政教系，下设政教专业；1986年增设政史专业（政治教育和历史教育双学科专业）；1993年增设经济法专业（非师范教育类），发展为拥有政教、政史、经济法三个专业的系。1984年，学校成立思想政治教研室（处级建制），负责形势与政策、法律基础、大学生思想修养、人生哲理、职业道德等课程的教学工作；1998年，学校设立基础部，思想政治教研室并入该部。
2000年三校合并升本后，政教系更名为政法系，承担全校思想政治教育专业和思想政治理论课的教学工作，所属思想政治教育专业是学校首批招收本科生的四个专业之一。2003年，思想政治教育专业被列为学校首批教改示范专业。2009年6月，学校决定成立思想政治理论课教学部；2011年1月13日，思想政治理论课教学部正式成立，与政法系合署办公。
2011年10月12日，马克思主义学院正式成立，是学校首批成立的四个二级学院之一。目前，马克思主义学院是学校思想政治教育专业和思想政治理论课的教学单位，同时又是马克思主义理论的研究机构、马克思主义理论学科的依托单位。
学院现拥有专任教师36人，其中教授4人，副教授12人，讲师18人，具有博士学位的教师4人，在读博士2人，45岁以下教师全部实现硕士化。拥有安徽省高校思想政治理论课带头人1人，安徽省优秀德育工作者1人，安徽省优秀教师1人，安徽省优秀思想政治理论课教师1人，淮南市宣传文化系统“四个一批”拔尖人才2人，校级拔尖人才1人，校级中青年学科带头人3人；中青年教师多人次荣获教学质量优秀奖、教坛新秀奖和青年教师教学基本功竞赛1等奖。
学院设有思想政治教育专业，该专业是学校师生比最高的专业；学院下设思政系和思政部，有思政专业教研室、基础原理教研室、概论纲要教研室、当代形势教研室；拥有校级A类重点学科“马克思主义中国化研究”；建有安徽省高校思政理论课建设工程项目：省级思政理论课教学“手拉手”共建基地。
近年来，马克思主义学院教师公开发表省级以上论文 230多篇，其中二类论文57篇；出版专著编著10余部。主持国家社科基金项目2项，省部级项目8项，主持安徽省教育厅项目20多项，淮南市科技计划项目3项，其他课题26项。安徽省高校思政理论课建设工程项目：“思政理论课带头人”1人，省高校思政理论课建设工程项目：“精彩一课”项目2项。各种教科研奖励20余项。省级精品课程2门，校级精品课程4门，校级教学团队2个。主持各级各类质量工程项目33项。