武汉大学 药学院，是新 武汉大学组建之后，为满足中国国民经济和药学事业的发展对高级药学人才（理论基础扎实，知识面宽，实践能力强）的迫切需求，在整合已有物质设备的基础上，由原生命科学学院药学系、 医学院（原 湖北医科大学）药学系、化学与分子科学学院及 人民医院（原湖北医科大学附属第一医院）药学部从事相关教学与科研的师资汇集而成。学院正式成立于2001年5月18日。2005年9月，其隶属关系由理学部调整至医学部。
武汉大学药学院成立于 2001 年 5 月 18 日，前身为原 武汉大学生命科学院药学系和医学院药学系（ 2 个系都是从 1994 年开始招药学本科生）。学院目前下设生物技术制药系、药物化学系、药剂学系、药理学系、药物分析学系等 5 个系，微生物及生化药学、 药剂学、 药物化学、 药理学、药物分析学和中药学等 6 个硕士学位授予点，挂靠基础医学博士学位授予点。 学院重视师资队伍建设，推进学科发展。学院现有教师 56 人，其中正、副教授 33 人，多数青年教师具有博士学位；先后聘请了 德国 WUPPERTAL 大学 ALTENBACH 等著名专家为兼职教授或客座教授，同时坚持每年从海内外引进多名教授和博士后人才，大大加强了在科研和教学方面的实力。学院成立以来，获国家级、省部级等科研项目 50 多项，公开出版学术专著 16 部，已获鉴定成果多项，获省部级科技进步奖 4 项，已申请各项专利 44 项 , 获批 35 项。
教学与科研条件学院加强基本建设，着力提升教学和科研条件。学院建成了拥有各类先进设备的药学实验中心和正在建设国家财政部修购计划支持的药理学、药剂学开放实验室。实验中心拥有包括 HPLC-MS 联用仪，红外光谱仪， 紫外光谱仪、 荧光光谱仪、 旋光仪， HPLC ， GC ，毛细管电泳仪等各类进口仪器设备。 2006 年又增置 400MHz 核磁共振仪等一批先进仪器。学校已经计划建设新的药学院大楼。
学院注重学生素质教育，鼓励创新思维，倡导特色学习，提供实践机会。近年先后建立了 庐山植物园、五峰县山区野生植物园、 罗田县野外实习基地，和 湖北省人民医院、 中南医院、 广州军区武汉总医院、 十堰市人民医院、武汉海特生物制药公司等多家实习和实践基地。近年学院招生规模稳步增长，目前在校本科生近 300 人，研究生 104 人，博士生 19 人，各类继续教育学生近 500 人。多年来，学院毕业生就业率连续在学校名列前茅，为社会输送了大量优秀人才。
学院推进产、学、研同步发展，建有“中药药剂国家三级实验室”和“湖北省中小企业共性技术研发推广中心（湖北省药物和药用材料研发中心）”，在积极为国家经济发展和地方建设服务方面作出了不懈努力。