医学院是嘉兴学院办学规模较大的学院，在院学生数达1700余名。目前开设有临床医学、护理学和药学3个本科专业，是浙北地区医学专业人才培养的重要基地。医学类专业至今已有60余年办学历史，是嘉兴学院各专业中开办时间最长的专业之一。围绕学校“做精医学”的发展思路，医学院在专业建设、学科建设、实验室建设、师资队伍建设、科学研究、人才培养等方面得到了迅速的发展，2012年在国内同类学校、省内医学院校中第一个通过教育部临床医学专业认证，办学影响不断扩大。
医学院现有专任教师63人，其中教授、副教授32人，高级职称教师数占教师总数50%，教师中具有博士学位教师21人、硕士学位教师37人，硕士及硕士以上学位教师数占教师总数95.08%。目前，学院还有2位教师正在攻读博士学位，2位教师正在攻读硕士学位。学院有一支高水平的师资队伍，拥有一批有较大影响的专家、学者，教师中国家“千人计划”特聘专家2人，享受国务院政府特殊津贴1人，省教学指导委员会成员2人，省“151人才”10人，市级学科带头人1人，博士、硕士生导师15人。此外还有外聘教师45人，其中外聘中国医科大学和美国北伊利诺伊大学教师各1人。
学院在学科建设方面取得了显著成绩。我院“药理学”被评为“浙江省重点学科”;“药学”被评为“嘉兴学院重点科”;附属医院“疼痛学科”被评为“浙江省中西医结合重点学科”;“康复医学”被评为“浙江省中医药重点学科”，“血吸病”、“康复医学”、“麻醉学科”被评为“浙江省医学重点扶植学科”，“消化”、“病理”、“骨科”、“儿科”、“围产医学”被评为“省市共建医学重点扶植建设学科”;另有28个学科被评为“嘉兴市卫生系统重点学科”。在这些重点学科的带动下，学院其它学科在学科建设方面均有了长足的进步和发展。
学院一贯注重科学研究工作，设有“医学形态研究所”、“医学机能研究所”、“药学研究所”、“临床基础研究所”等四个科学研究机构，学院及附属医院拥有嘉兴市重点科技创新团队5个。建立了以嘉兴市重点实验室——医学分子生物学实验室为依托的共享共用的科研平台，包括细胞生物学实验室、分子生物学实验室、分子药理学实验室、细胞组织工程实验室、病原微生物学实验室、SPF级实验动物房等学科实验室。近5年来，学院获得了大量的各级科研立项课题，其中获得国家和省级项目21项，市厅级项目69项。公开发表科研论文451篇，其中SCI论文63篇，一级期刊论文55篇，编写教材32部。获省、市级科技成果奖35项。实验室建设水平是衡量办学实力的重要条件。