商丘工学院的前身是商丘广播电视中专，1994年9月诞生于商丘地委党校租来的一栋教学楼里。
1996年5月，学校新校园开工奠基仪式在商丘市东郊举行；1996年9月，全体师生搬进刚落成的新校园。
1998年8月，在商丘广播电视中专基础上学院提高办学层次，更名为商丘科技专修学院。
1999年，学院二期工程建设起步。
2001年，学院正式开始申办高职院校；2002年12月获批成立商丘科技职业学院。
2003年，学院三期工程建设全面铺开；2004年九月，全院师生搬进新校区上课。
2007年10月，中共商丘科技职业学院委员会成立。同月，学院顺利通过省教育厅高校德育工作评估。
2007年12月，学院第一次升本工作接受省高校设置评议委员会考察评审。因毕业生届数不够，审核未能通过。
2009年4月，原外交部部长李肇星接受担任学院名誉院长。
2011年5月，学校正式升格为本科院校建制的商丘工学院。
办学条件师资力量截止2014年6月，学院有教职工712人，专任教师542人，具有高级专业技术职务的168人，具有硕士研究生以上学历的教师172人；聘请校外教师181人，具有高级专业技术职务的51人，具有硕士研究生以上学历的教师101人。
院系设置截至2014年6月，学校设有机械工程学院、土木工程学院、管理学院、信息与电子工程学院、护理学院、传媒与现代艺术学院、继续教育学院及思想政治理论教学部、体育教学部、基础教学部10个教学院部，开设有55个本、专科专业。
学科建设“机械制造及其自动化”被评为河南省重点学科。
教学建设学校的“建筑工程技术”专业被评为河南省品牌专业；学校的本科特色专业为：计算机科学与技术、电子信息工程、土木工程、会计学和市场营销专业；汽车检测与维修技术、动漫设计与制作、数控技术等专科专业也是该校的传统特色专业。
学校推行具有特色的“七项能力”培养项目，即：学生除完成国家规定的教学课程外，还要选修“艺术欣赏”、“阅读赏析”、“沟通交往”、“信息处理”、“外语应用”、“汽车驾驶”和“创新创业”七项能力培养课程。
学术科研科研成果截止2014年6月，学校教师主持参与的省部级科研项目共有30余项，省厅级课题（项目）共有120余项，学校教师先后在CN刊号的学术期刊上发表论文共100余篇，主编或参编出版著作、教材90余部。
2013年9月，学校“经济结构调整对教育发展方式转变的影响研究”等7项科研课题获准省厅级结项；?2014年5月，学校“视、音频信息采集和生产指挥调度系统”科研项目获河南省教育厅2014年度科技成果二等奖。