温州医科大学是中国率先开展眼视光学研究和高等教育的学术机构。1978年，温州医学院在中国首次招收以眼科光学为研究方向的研究生；1988年，开设眼视光学专业，成立中国第一个培养眼视光学高级医学专业人才的眼视光系；1992年，经国家卫生部批准建立卫生部视光学研究中心；1997年建立了眼视光学院；2000年经国务院学位办批准，开始和美国新英格兰视光学院联合培养眼视光学博士；2002年开始招收七年制眼视光学专业本硕连读学生，五年制眼视光学专业被评为浙江省重点建设专业；2003年经国家卫生部批准建立卫生部视觉科学研究重点实验室；2006年经国务院学位办批准成为博士点；2007年，眼视光学教学团队入选教育部国家级教学团队。同年，眼视光学院入选教育部国家级人才培养模式创新实验区，并于2008年入选教育部国家级高等学校特色专业建设点。2008年，眼视光学专业入选浙江省首批高等院校重点专业，2012年入选浙江省本科院校“十二五”优势专业建设项目，并将作为浙江省第二批24个重点扶持专业之一，推荐申报2013年国家级专业综合改革试点项目。2009年，眼视光学实验教学中心入选国家级实验教学示范中心建设项目，2012年通过专家验收。学院成功申报国家级双语教学示范课程1门（2008年）、国家精品课程2门（2005,2009年）、获得浙江省推荐申报国家级精品资源共享课程1门（2012年）。2008年-2012年，出版各类专著教材20部，卫生部医学视听教材4部。2011年,作为主任委员单位牵头编写的“全国高等学校“十二五”眼视光学专业国家级规划教材由人民卫生出版社正式出版。2012年，瞿佳主编高等教育出版社出版的《眼科学》教材，入选教育第一批“十二五”普通高等教育本科国家级规划教材。获得了国家级教学成果二等奖1项（2009年）、浙江省教学成果一等奖1项（2009年）和全国教育系统先进集体1次（2009年）。2012年，中国教育部颁布《普通高等学校本科专业目录（2012年）》，特设眼视光医学专业（100204TK），明确归属临床医学类别。
教学科研温州医科大学眼视光学院师资力量雄厚，拥有专职教师138人，其中高级职称67人，博士学历76人，学科带头人在国内外视光学界具有较高的知名度和影响力。承担和主持国家自然科学基金项目、国家“973”项目、国家“十五”科技攻关项目、国家“十一五”科技支撑计划项目、国家“863”子项目、浙江省自然科学基金重大项目和国际合作项目等100余项，获得包括国家科技进步二等奖、浙江省科学技术进步奖等数十项各类奖项。
该学院是省部共建眼视光学国家重点实验室培育基地、国家视光工程技术研究中心、卫生部视光学研究中心、卫生部视觉科学研究重点实验室、中华眼科学会眼视光学组长单位、国家标准化委员会眼科光学与器械分委员会副主任单位、教育部现代眼视光技术与装备工程研究中心、科技部眼科和视光医疗器械产业技术创新战略联盟、教育部视光学及材料创新团队、国际标准化组织（ISO）眼科光学与仪器国际标准工作组成员单位，浙江省“重中之重”重点学科承担单位、浙江省眼视光学研究重点实验室、浙江省视光产业技术创新服务平台、浙江省眼镜行业科技创新服务中心、浙江省眼镜产品质量检验中心和温州市眼镜行业技术研究中心。由于眼视光学科在视光学领域的国际影响，全球首个特殊奥林匹克运动医学健康中心落户在该学院。