浙江水产学院，前身为舟山水产学院，1958年9月22日创建于舟山，从事普通本科教育。
1958年10月，浙江省水产干部学校并入，学校迁入定海城关北门外义桥;次年3月，岱山水产学校也并入。1959年12月，根据中共浙江省委决定，舟山水产学院与浙江农学院、天目林学院合并成立浙江农业大学，改称浙江农业大学水产学院。1962年，舟山水产学院从浙江农业大学分出单独建制;同年4月，省委决定，学校党委工作划归舟山地委领导，业务上划归省教育厅直接领导。
1964年，省委确定舟山水产学院为实行“两种教育制度”的试点单位，试行半工(渔)半读。1966年以后，受“文化大革命”的影响，学校本科教育停止招生达11年之久，1975年8月16日经国务院批准恢复舟山水产学院，并改名为浙江水产学院。1978年3月，省革命委员会将学校的管理体制改由省和舟山地区双重领导，浙江省水产局为行政业务主管部门;同年春季，学校招收了复校后的第一批新生。
1984年，学校改由省教委主管;1985年，省政府批准在宁波姚江文教区建立宁波分院。1995年底，省委、省政府决定，宁波分院划归宁波大学，浙江水产学院本部仍留在舟山。1996年5月，省委决定浙江水产学院由普陀迁入定海城区，在舟山师范专科学校基础上扩建新校舍，并与舟山师专联合办学。