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2006年6月，北京大学软件与微电子学院通过了教育部组织的国家示范性软件学院的验收评估，综合排名第一。2007年1月北京大学软件与微电子学院通过了教育部组织的国家集成电路人才培养基地中期评估。“北京大学示范性软件学院建设” 于2TBL_0TBL_04年获得北京大学教学成果一等奖、北京市教学成果一等奖，于2TBL_0TBL_05年又获得高等教育国家级教学成果一等奖。

20011年国务院学位委员会下发了《关于下达工程博士专业学位授予单位名单的通知》（学位【2011】72号文件）。根据国务院学位委员会“关于下达工程博士专业学位授予单位名单的通知”，北京大学软件与微电子学院获准招收工程博士（电子与信息领域）。2012年正式招生，研究方向为：1、软件工程专业方向；2、集成电路工程专业方向。

北京大学软件与微电子学院现有十个系：软件技术系、网络与通信技术系、嵌入式系统系、服务科学与工程系、集成电路设计与工程系、管理与技术系、数字艺术系、金融信息工程系、语言信息工程系、信息安全系；27个培养方向：软件开发、软件质量工程与测试、软件项目管理、信息监理、嵌入式系统工程、移动通信服务终端、数字家电、网络与通信工程、信息安全、电信运营支撑、电子政务、电子交易、电子金融、电子通信、IT企业创业与创新管理、IT市场营销、IT项目管理、专用集成电路（ASIC）设计、系统芯片（SOC）设计、集成电路设计方法学、电脑动画、数字艺术技术、电脑游戏设计、电脑游戏编程、影视制作、语言信息处理、计算机辅助翻译等。