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滨州医学院的前身是始建于1946年的原青岛医学院。1970年10月，青岛医学院整体搬迁至山东省惠民地区行署驻地北镇；1974年11月，设立青岛医学院北镇分院（为省属本科高等院校）；1981年9月，改称北镇医学院；1983年3月，随驻地更名为滨州医学院。

学校全日制在校生14000余人，其中本科生12000余人，面向全国22个省（市、自治区）招生。

学校设有临床学院、基础学院、特教学院（医学二系）、口腔学院、护理学院、医学人文学院、中西医结合学院、药学院、卫生管理学院、成人教育学院等10个院（系）。

设有临床医学、口腔医学、护理学、生物技术、中医学（中西医结合方向）、信息管理与信息系统、麻醉学、医学影像学、法学（医事法律方向）、统计学（卫生统计学方向）、英语（医学方向）、药学（临床药学方向）、应用心理学（临床心理学方向）、公共事业管理学、预防医学、劳动与社会保障等17个本科专业和方向。

现有人体解剖与组织胚胎学、内科学、口腔临床医学、免疫学、病理学与病理生理学、外科学、妇产科学、儿科学、眼科学、影像医学与核医学、皮肤病与性病学、中西医结合临床等12个硕士学位授权点；有医学免疫学、口腔科学、临床营养支持中心（肝胆外科）、内科学、人体解剖与组织胚胎学、病理学与病理生理学等6个省级重点学科，另有9个校级重点学科。

口腔医学专业为山东省特色专业和省级教学改革试点专业，2007年被批准为国家特色专业；病理学、组织学与胚胎学、儿科学等3门课程为省级教学改革试点课程；组织学与胚胎学、病理学、生物化学、药理学、病理生理学、生理学等6门课程为省级精品课程，另有校级精品课程16门。

“十五”以来，学校共承担各类科研课题256项，其中国家级6项，省部级40项，厅局级96项；获省级科技进步奖10项，厅局级奖励164项；获省级教学成果奖11项，其中一等奖2项；出版专著、教材150部，发表论文3081篇，其中核心期刊1173篇，被SCI、EI等收录47篇。

主办中国医学统计类核心期刊《中国医院统计》和中国学术期刊综合评价数据库来源期刊《滨州医学院学报》，均向国内外公开发行。

学校现有教职工939人，其中专任教师648人。有教授85人，副教授220人，博士、硕士学位人员358人；全国优秀教师3人，教育部高等学校骨干教师2人，山东省中青年学术骨干、学科带头人培养对象16人，山东省教学名师2人，山东省优秀教师3人，山东省师德标兵1人，享受政府特殊津贴专家4人，滨州市有突出贡献专家5人。

学校固定资产总值8亿元，教学科研仪器设备总值9000余万元；图书馆藏书188万册；有直属附属医院1所，非直属附属医院8所，教学医院、实践教学医院60余所。学校直属附属医院建筑面积16万平方米，资产总值5.8亿元，仪器设备总值1.7亿元，开放床位941张，是鲁北地区医疗、教学、科研、保健、康复中心。