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党委副书记：蒋晓铭副教授。分管学生（含留学生）、宣传（武装）、统战、工会、共青团、思政工作。

副院长：陶仪声蚌埠市政协副主席，教授，主任医师，硕士生导师。分管教学、招生考试工作。

副院长：王俊和副教授，主任医师，硕士生导师。分管第一附属医院、第二附属医院、研究生工作。

副院长：张武丽高级政工师，硕士生导师。分管后勤（后勤管理处、后勤集团）、图文信息中心（图书馆、网络中心）、离退休人员工作。

纪委书记：杨烨副研究员。分管纪检、监审、保卫工作。

学校获省厅级以上科研立项300余项，承担国家自然科学基金项目10余项，合作国家自然科学基金、973计划等项目20余项，发表各类论文3000余篇，出版教材、专著20余部。参与国家重点基础研究发展计划（973计划）课题2项，与世界卫生组织（WHO）、清华大学国家辐射专业实验室等有多项合作课题；先后获得省部级以上科学技术奖百余项（其中一等奖3项），卫生部科技进步二等奖2项。每年在国内外发表学术论文数百篇，2005年达509篇；公开出版发行《蚌埠医学院学报》、《解剖与临床》、《实用全科医学》三种学术刊物。