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化学与生物工程学院学术风气浓厚，三明市首家省级工程中心-福建省固定床洁净煤气化工程技术研究中心、首家高校技术中心-福建省高校药用植物开发利用工程研究中心均落户学院，同时成立了林产化学与涂料研究所、应用生物技术研究所、复旦大学-三明学院天然药物工程研究中心、应用化学与化工技术研究所，为教师开展科研及学生科技创新能力的培养提供了良好的教学、科研平台。积极开展与地方企事业单位的合作与交流，目前承担各级各类研究项目80多项，获科研经费1000多万元，其中有省级课题26项，市级科研立项8项，科研成果显著。近年学院教师发表论文600多篇，其中SCI收录32篇，EI收录20篇，国家级核心刊物发表100多篇，获得国家专利5项，福建省科技进步三等奖2项，三明市科技进步二等奖1项，科研成果名列全校前茅，在服务海西建设和为地方经济服务中做出突出贡献。重视培养学生的初步科研与创新能力，指导学生开展科研，学生第一作者发表论文共50多篇，多项荣获全省大学生课外科技活动“挑战杯”竞赛二、三等奖。