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2000年基础实验室通过省级评估，2001年动物医学专业实验室也以优良成绩通过学校的评估。根据教育部学位与研究生教育发展中心公布的结果，在2003年全国一级学科评估中，学院兽医学整体水平名列该一级学科全国第四，其中人才培养指标名列全国第一。[9]

学院有动物医学本科专业，设动物医学、检验检疫和实验动物3个专业方向，面向江苏省及全国多个省市招生。该专业2005年被确定为江苏省第一批品牌专业，2007年被教育部确定为高等学校特色专业建设点。2009年动物医学实验教学中心被确定为江苏省实验教学示范中心。[10]

该专业以国家级、省级重点学科为依托，建有完整的国家级、省级和校级精品课程体系，拥有一支高水平师资队伍，取得了一批重要的教学科研成果，2006年“动物传染病学”课程被评为国家精品课程，2007年动物医学专业、兽医人才培养模式创新实验区被列为教育部“质量工程”建设项目，2009年“兽医微生物学”课程被评为国家精品课程。[11]

学院重视科研工作，有100余项成果分获国家、部、省、厅级奖励。在世界上率先发现小鹅瘟、兔瘟等病毒，并研制出疫苗；与中科院共同完成的“转基因山羊体细胞克隆山羊”成果被评为1999年中国基础研究十大新闻之首；“鸡传染性法氏囊病中等毒力活疫苗（NF8株）的研制”成果荣获国家科技进步二等奖、江苏省科技进步一等奖；“H9亚型低致病性禽流感疫苗”获江苏省科技进步一等奖；有2篇博士学位论文被评为全国百篇优秀博士学位论文，有多篇学位论文被评为江苏省优秀博士、硕士学位论文、全国兽医专业学位优秀硕士学位论文。[12]