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学校拥有良好的科研条件，建有湛江校区和东莞校区两大科研中心，拥有广东天然药物研究与开发重点实验室、广东省医学分子诊断重点实验室、广东省衰老相关心脑疾病重点实验室、粤西高校分析中心、医学生物活性分子研究重点实验室、现代生物化学与分子生物学重点实验室、神经变性疾病与衰老研究医学重点实验室、病证结合二级实验室、湛江市环北部湾海岸特色微藻生物资源产品研发重点实验室、湛江市肝胆相关疾病重点实验室、东莞市环境医学重点实验室等11个省、厅、市级重点实验室以及中美联合肿瘤研究所，中美基因、营养与健康研究所，衰老研究所，中药与新药研究所等4个中外联合科研平台。

广东医学院（原湛江医学院）图书馆创建于1958年，原名中山医学院湛江分院图书馆，文献资源主要由中山医学院图书馆调拨。1964年后独立办馆，易名为湛江医学院图书馆，1992年随学校易名为广东医学院图书馆。 广东医学院图书馆由湛江校区图书馆和东莞校区图书馆两部分组成，总建筑面积31960平方米，生均面积3.33平方米，其中湛江校图书馆1984年落成启用，建筑面积5344平方米，东莞校区图书馆2005年落成启用，建筑面积26616平方米,是学校的标志性建筑。累积馆藏文献总量216.1万册。