该系的前身为福州大学电机系，创建于1958年，是当时福州大学建校首批设置的五个系之一，担负着培养电气工程、自动化控制科学和技术方面的高级工程科技人才的任务。
经过40多年的发展，学院培养了大批基础扎实、知识面广、适应能力强的高级电气工程与自动化科技人才，其中，本专科毕业生6000多名，硕士130名，博士16名。学院在校本科生1000多名、硕士生100多名、博士生20多名、工程硕士生130多名、函授生1000多名。
师资力量学院师资力量雄厚，拥有一批朝气蓬勃的中青年教授、副教授。现有教工128名，其中专任教师79名，博士生导师5名，教授10名，副教授27名，具有硕士以上学历的教师48名。另外，学院的自动化工程技术研究中心现有员工350名。
1996年该院“电机电器及控制”学科列入省“211工程”重点建设项目，已投入重点建设经费近千万元，建成了具有国内先进水平的电器检测中心、高频磁技术研究中心。对实验室的建设还将陆续投入重点建设经费600万元。福州大学电器检测中心已通过中国实验室国家认可委员会认可和福建省质量技术监督局计量认证，成为国家级实验室，该中心将发挥该院的学科优势，为我国电器事业的发展做出贡献。
办学成就学院与新大陆集团、闽东电机集团、省电力总公司、福州天宇集团、三钢集团有限责任公司、福州人造板厂、福州福大自动化科技开发有限公司、中国。德力西集团、台湾台达集团等企业建立了长期合作或研发关系，签订了产学研合作协议，在水口发电有限公司、厦门嵩屿电厂、德力西集团、三钢集团有限责任公司等8个企业建立了学生实践基地。德力西集团、福州福大自动化科技开发有限公司等企业在该院设立学生奖助学金，奖励学习优秀或贫困的学生，学生就业率名列福州大学各学院的前茅。
学院正以本科教学为基础，学科建设为重点，博士点、硕士点建设为前导，努力进行教学改革的探索和实践，坚持教学与科研相结合的办学方针，走产学研科技合作道路，努力为我国特别是福建省的经济建设服务。