阜阳职业技术学院工程科技学院，下设机电工程系和信息技术系，现有机电一体化技术、数控技术、模具设计与制造、应用电子技术、机械制造与自动化、计算机应用技术、计算机网络技术、工程造价、汽车检测与维修技术、建筑工程管理、建筑工程技术、汽车技术服务与营销、图形图像制作等13个专业，计算机专业是教育部教学改革试点专业，数控专业是国家骨干校重点专业、安徽省特色专业，机电一体化专业是国家骨干校重点专业省级教学改革试点专业，建筑工程技术专业是中央财政支持专业，计算机网络技术专业是安徽省特色专业，2012年全日制在校生2599人。
本院具有一支专兼结合，素质优良的双师型教学团队，专职教师中具有高级职称的24人，硕士以上学位的35人，技师4人，高级工25人，中级工7人。有国家级优秀教师1名，省级优秀教师3名，曾宪梓教学基金奖获得者1名，阜阳市专业技术拔尖人才1名。有3位教师出国进修学习，有25人从企业调来或到企业生产第一线参加过锻炼，51人到相关高校、企业和职业教育师资培训中心参加过培训。
本院已建成数控实训车间、车工实训车间、钳工实训车间、汽车发动机构造与维修实训室、汽车底盘构造与维修实训室、汽车电器构造与维修实训室、汽车整车结构与检测实训室、CAD/CAM实训室、数控仿真实训室、数控维修实训室、三坐标测量实训室、机械原理演示室、机械制图实训室、模具实训室、单片机实训室、可编程控制（PLC）实训室、电工电子实训室、机床电控实训室、家电实验室、电子工艺实训室、变频调速实验室、电工考核实训室、贴片技术实训室、传感器实验室、网络实训室、多媒体技术实训室、组装维护实训室、图形设计室、综合布线实训室、水泥质量检测实训室、混凝土质量检测实训室、力学实验室、工种实训室、建筑构造实训室、砌体结构工程施工实训室、混凝土结构工程施工实训室、建筑材料博物馆等专业实训实验室60多个，与全校共用基础计算机室15个，教学仪器设备价值约3000万元。
本院积极推行职业资格证书制度，是国家职业技能鉴定所的培训和鉴定基地，有一支理论基础扎实、操作技能精湛的双师素质教师队伍和考评员队伍，有考评员20人，目前已开展的职业技能鉴定有数控车床工、数控铣床操作工、车工、钳工、维修电工、无线电装接工、计算机系统操作工、文字录入员、多媒体制作员、汽车维修、汽车电路等10多个工种，学生毕业前绝大多数获得2个高级或中级工职业资格证书。由于我们高度重视实践技能训练，我院学生在国家级、省级职业技能竞赛中成绩斐然， 2010年全省高职院校技能竞赛9名学生获得三等奖。2010年6月我院陈传奇、杨海涛、赵海洋三位学生组队代表安徽省参加全国职业院校技能大赛，获得三等奖。2011年陈晨参加第六届全国信息技术应用能力大赛获全国二等奖。2012年，机电专业3名学生或全国自动线安装与调试竞赛三等奖。七个团队获安徽省技能大赛三等奖。