基础医学与法医学院前身为基础部，成立于 1988年8月13日 ，2007年11月更名为基础学院，2010年6月更名为基础医学与法医学院，是我校最大的教学单位。
现设有综合科、教学管理科、学生管理科（团总支）、12个教研室、1个基础医学实验教学中心和9个研究所（室）。目前法医学专业隶属基础医学与法医学院管理。
现有教职工171人，其中，教授21人，副教授37人，讲师70人；高级实验师11人；博士10人，硕士74人；享受国务院特殊津贴2人，全国劳模1人，全国优秀教师1人，省级教学名师4人，校级教学名师3人，济宁市科技功臣1人。
现有1个省级重点学科、4个校级重点学科（实验室），1个省级实验教学示范中心。共有1门国家级精品课程，2个省级教学团队、3个校级教学团队,4门省级精品课程、2门省级成人高等教育特色课程、6门校级精品课程和2门校级优质课程。
承担着全校临床医学、预防医学、口腔医学、医学影像学、法医学、护理学、医学检验、康复治疗学、应用心理学等专业医学基础课程的教学任务。近五年来在国内外学术期期刊发表论文500余篇，出版著作40余部，承担省级以上课题30余项。
学院将以科学发展观为指导，以教学质量为中心，加强内涵建设，全面提高教育教学质量，努力建设成为教学水平高、综合科研实力强、专业特色鲜明的二级学院。