1951年，创建中国人民解放军东北军区军医学校。
1953年1月，更名中国人民解放军第十一军医中学。南方医科大
1954年5月，根据全军《军医中学整编方案》，学校改称中国人民解放军第十一军医学校。
1956年1月18日，学校由原属东北军区领导转由总后勤部领导。
1958年7月，学校集体转业，移交黑龙江省人民政府领导，第十一军医学校与第2164医院合并，改名为“齐齐哈尔医学院”，学制由原来的3年改为5年。
1962年1月，学校重归军队，隶属总后勤部，校名为“中国人民解放军齐齐哈尔医学院”。
1966年10月，校名改为“中国人民解放军军医学院”。
1969年9月，学校迁至湖南省长沙市。
1970年，广州军区卫生学校并入；2月，学校再迁至广州市当时已停办的暨南大学校址，由广州军区代管。
原第一军医大学1975年7月，中央军委决定将原由广州军区代管的军医学院改由总后勤部领导，“为统一番号序列，原中国人民解放军军医学院改为第一军医大学，并隶属总后勤部建制”。
南方医科大学(17张)1978年，原暨南大学恢复办学；4月，中央军委批准第一军医大学新址定于广州市东北郊麒麟岗。
1979年被确定为中国重点大学。
1980年，广州军区军医学校再次并入。
1993年，第一军医大学（护理系，原广州军区军医学校部分）分出，改建解放军广州医学高等专科学校。
1999年，解放军广州医学高等专科学校第三次并入。
2004年被批准为全国首批8所试办八年制医学教育的高等院校之一。
南方医科大学2004年8月按照国务院、中央军委下达的命令，整体移交广东省，更名为南方医科大学。
办学条件院系设置南方医科大学开设了26个本科专业，现有全日制在校生15514人，其中本专科生12061人、研究生3027人、留学生501人。
（表格参考资料：）
师资力量学校现有专业技术人员6079人，其中高级专业技术职称1100人。拥有院士3名，双聘院士2名，“973”项目首席科学家2名，国家教学名师2名，全国模范教师和全国优秀教师5人，全国高校骨干教师7人，广东省教学名师6人，“长江学者”4人，国家杰出青年基金获得者5人，“何梁何利奖”获得者3人，“新世纪百千万人才工程”国家级人选6人，国家级教学团队2个，博士生导师236名、硕士生导师639名，先后有133人享受国务院特殊津贴。