东南大学医学院位于四时秀丽的玄武湖畔，美丽的金川河环绕而过，校园里风景优美、环境清幽，处闹市而不喧嚣。学院的办学历史可追溯至1935年，国立中央大学以“南京为首都所在，而无一完善之医学教育机关”为由，报呈国民政府获准增设医学院。抗日战争爆发后，医学院随校西迁入川，并与齐鲁、华西两校联合建立“三大学联合医院”，公推中央大学医学院戚寿南院长任总院长。抗战胜利后，迁回南京，安置在国立中央大学丁家桥二部（学院现址）。风雨苍桑，几多变迁。后相继成为南京大学医学院、中国人民解放军华东军区军医学院、中国人民解放军第三军医学院、中国人民解放军第五军医大学、中国人民解放军第六军医学校、南京铁道医学院。2000年4月，南京铁道医学院与东南大学合并。在70余年办学历史中，潘铭紫、戚寿南、郑集、蔡翘、周金黄、康锡荣、郭绍周、荣独山、黄克维、董秉奇、程玉麐、汤飞凡、姜泗长、阴毓璋、张致一、王世真、丁光生、王士雯、张涤生、牟善初、贺林、杨焕明等一批声名卓著的医学名家和教育大家曾在这片土地上工作或学习，为祖国的医药卫生事业作出了巨大贡献，其中中国科学院院士贺林与杨焕明为学院改革开发以后培养的优秀毕业生。[1]
东南大学医学院现设有病原生物学与免疫学、遗传学与发育生物学、病理学与病理生理学、人体解剖学与组织胚胎学、生理学与药理学五个基础医学系，内外妇儿，护理，神经精神，影像，肿瘤，重症医学，检验，传染病，运动康复，等十二个临床医学系，数十个教研室；有2个博士后流动站；拥有十四个医学科学研究所，一个医学实验教学中心，和一个省级实验示范中心。 学院拥有2个省级重点学科，3个江苏省重点实验室。临床教学基地包括1所直属附属医院和9所非直属附属医院，总床位数万余张。直属附属医院—中大医院是江苏省首批三级甲等综合性医院，其重症医学，影像医学等学科在国内有重要影响。
学院现有一级学科博士点4个，二级学科博士点18个（内科学、外科学、免疫学等），一级学科硕士点23个（基础医学、临床医学、生物学、护理学），博士后流动站2个（临床医学、生物学），“长江学者奖励计划”特聘教授设岗学科1个（遗传学），江苏省优势学科1个(医学技术),江苏省重点学科2个（临床医学、遗传学），省部级重点实验室3个（江苏省高校分子影像与功能影像实验室、江苏省基因诊断与基因治疗医学重点实验室、发育与疾病相关基因教育部重点实验室），卫生部国家临床重点专科1个（急诊与重症医学），江苏省临床诊疗中心2个（介入放射学、重症医学），江苏省临床重点专科15个，江苏省基础医学实验教学示范中心1个，国家临床技能培训中心1个。临床教学基地包括1所直属附属医院和9所非直属附属医院，总床位数超过万张，直属附属医院——中大医院是江苏省首批三级甲等综合性医院，其重症医学，影像医学等学科在国内有重要影响；另外还有近10家生物工程专业实习基地。遗传学为“长江学者奖励计划”特聘教授设岗学科。医学影像学为国家级特色专业,重症医学为国家临床重点专科。学院已形成了从本科生、硕士生、博士生、博士后到留学生一整套人才培养体系。2012年入选教育部卓越医生培养计划-拔尖创新人才培养计划，开始试办八年制医学教育，目标是培养杰出的领导型临床学家和医学科学家，办学理念和人才培养独具特色。招生专业包括临床医学(8年制,七年制和5年制)，医学影像，医学检验，护理学，生物工程等5个专业。2012年有在校学生2400余人，其中本科生1400人，硕士生622人，博士生143人，海外学院留学生322人。