深圳南方科技大学被确定为国家高等教育综合改革试验校。2011年3月，南方科技大学教改实验班开学。2012年4月，教育部同意建立南方科技大学，并赋予学校探索具有中国特色的现代大学制度、探索创新人才培养模式的重大使命。
深圳南方科技大学学科设置以理工科为主，兼具部分特色人文社会学科与管理学科。首批设立物理学、化学、生物学、微纳材料与器件、金融数学与金融工程等5个系，开设物理学、化学、生物信息学、生物技术、微电子科学与工程、金融数学等6个专业。
深圳南方科技大学初步建成了一支国际化高水平的教师队伍。教学科研人员中90%以上拥有博士学位，95%以上从海外引进，60%以上教师具有在世界排名前100名大学学习或工作经历。
深圳南方科技大学着力建立有利于教育公平、创新人才选拔的多元录取机制和先进的全面教育体系。学校2012年采用基于高考的综合评价录取模式招收优秀学生，招生制度改革获初步成功。学校采用个性化的培养模式，院士亲自授课、小班制教学、书院制管理，努力培养创新人才。
深圳南方科技大学致力建设符合现代大学制度的法人治理结构。学校设理事会、校长、校务委员会和校学术委员会，建立了教授会和顾问委员会。
深圳南方科技大学新校区占地面积194.38万平方米，环境优美、交通便利，校园内九山一水，风景如画，建筑彰显“厚重、节能、实用、环保”理念。
未来，南方科技大学将发扬“敢闯敢试、求真务实、改革创新、追求卓越”的创校精神，突出创新、高端、前沿、国际四大办学特色，大力培养创新人才，早日实现办学目标。