植物保护学院是 1952 年建校伊始的主要院系之一，是由农业教育家、植物病理学家吴友三教授、张际中教授，农业教育家、昆虫学家任明道教授等老一辈科学家创立的。植物保护学院历经几代沈农植保人的辛勤耕耘，已发展成为拥有覆盖植物病理学、农业昆虫与害虫防治、农药学和有害生物与环境安全 4个硕士、博士授予权的一级学科点以及植物保护学科博士后流动站；植物病理学科属农业部和辽宁省重点学科；拥有农业部北方农作物病害免疫重点开放实验室和辽宁省教育厅植物病害重点实验室，是农业部农药登记药效试验认证单位、和辽宁省蔬菜抗病性鉴定单位。
植物保护学院设有植物保护和应用化学两个本科专业。现有教职工47名，其中，教师27名，专职科研人员8名；教授13名，副教授10名，高级实验师3名。中青年教师基本实现博士化。植物保护学院现有博士生导师 8 名，硕士生导师 18 名；目前，植物保护学院已形成一支学历层次高、梯队结构合理，以中青年教师为骨干的师资队伍。已经成功举办了两届沈阳农业大学植物保护理论与技术国际培训班。植物病理学、农业昆虫与害虫防治、农药学三个教研室均为学校优秀教研室。
植物保护学院近年来在教学、科研等领域均取得较大成就。教学工作注重师资培养和课程建设，曾获辽宁省优秀教学成果一等奖 2 项、 1 门课程被评为辽宁省精品课、 3 门课程被评为辽宁省优秀课、 农业昆虫学实验室和植物病理学实验室被辽宁省教育厅评为双基合格实验室、 1人获全国优秀教师和辽宁省教学名师称号、2篇研究生论文分别获辽宁省优秀博士和硕士论文。我校 植物保护一 级学科进入 全国研究生教育一级学科前十名。科研工作在玉米、小麦、大豆、水稻、蔬菜和中药材病虫害研究领域成果显著，近五年来主持各类科研课题 30余项、获奖成果15项、发表论文260篇、著作40余部、专利3项。
面对二十一世纪我国加入 WTO 的机遇和挑战，植物保护学院全体师生正瞄准世界植物保护学科的发展前沿，求真务实、开拓进取，力争在学科建设和教学、科研工作中取得新的更大成绩！