2005年新增生物技术专业。
2006年获批生物科学本科专业。
2010年食品质量与安全专业获批招生。
2012年新增食品科学与工程专业。
2014年宿州学院生物与化学工程学院拆分为宿州学院生物与食品工程学院和 宿州学院化学化工学院。
师资力量生物与食品工程学院设有生物技术、生物科学、食品三个教研室。现有教师34人，其中教授5人、副教授7人、高级实验师1人，博士8人，在读博士4人；省教学名师1人；3人获校青年教师教学比赛一等奖，每年聘请兼职教授2人，从企业聘请兼职教师10余人。
教学设施生物与食品工程学院拥有各类基础实验室和研究室25个，实验室总面积约6000平方米，拥有高效液相色谱仪、流式细胞仪、倒置荧光显微镜及图像分析系统、扫描酶标仪、荧光定量PCR仪、荧光化学发光成像系统、凝胶成像系统等大型仪器设备，设备总值近1200万元，能够开设本专科教学大纲规定的所有实验。建设有分子生物学、仪器分析、环境农残检测、生化分离、组织培养、仿真实验室、动物细胞培养室等应用型实验室以及水处理、啤酒生产线和GMP生产线、食用菌栽培实训室、食品分析与检测实训室、食品加工工艺实训室、果蔬生产线实训室、种植养殖校内实习基地等校内实训基地。
质量工程生物与食品工程学院拥有省级教学团队（生物技术教学团队）1个，省级特色专业（生物技术专业）1个，省人才培养模式创新实验区（地方本科院校生物技术专业产学研合作人才培养模式创新实验区）1个，省级示范实习实训中心（生物）1个，省级精品课程(遗传学精品课程)1门，省级精品资源共享课(植物学)1门，省级卓越人才教育培养计划（生物科学专业“卓越人才教育培养计划”）1个，省级教改示范专业(生物技术专业)1个，省级专业综合改革试点（生物技术专业综合改革试点）1个，省级专业改革与新专业建设项目（食品质量与安全专业）1个，省级优秀教育管理工作者1人。承担省级教学研究重大项目、重点项目2项、一般项目5项；获省教学成果奖3项。
科研成果生物与食品工程学院教师教学水平高、科研能力强，近几年在省级以上刊物上公开发表学术论文200余篇，其中被SCI、EI检索50篇；出版教材、学术专著6部；专利7项；主持 国家自然科学基金1项，农业部优势农产品重大技术推广项目2项，博士后基金项目1项，省自然科学基金项目3项，科技厅年度计划项目1项，省教育厅自然科学研究重点项目11项、一般项目29项。获省科技论文三等奖16项，3人分别获宿州市第二、三、五届青年科技奖，1人获宿州市科学技术三等奖。
专业设置