温州医科大学是浙江省省属重点建设大学。学校可溯源至创办于1912年的浙江医学专门学校，1958年8月由浙江医学院从杭州分迁至温州建立，初名“浙江第二医学院”，后以校址所在地改名为“温州医学院”，2013年更名为“温州医科大学”。2013年，温州医科大学入选国家首批临床医学研究生培养模式改革试点高校，是浙江省首个“国家医师资格考试实践技能考试与考官培训基地”。
学校1958年开始招收五年制本科学生，是全国首批硕士学位授予单位，具有博士学位授予权。有临床医学一级学科博士点；有临床医学、中药学、生物学、生物医学工程、基础医学、中西医结合、药学、护理学等8个一级学科硕士点；有临床医学、中药学、口腔医学硕士、生物医学工程、中西医结合临床、全科医学、临床病理学7个专业学位授予权。设有临床医学一级学科博士后科研流动站。拥有推荐优秀应届本科毕业生免试攻读硕士学位资格。
学校现拥有国家工程技术研究中心1个，省部共建国家重点实验室培育基地1个，省部级及以上重点实验室（研究中心）11个，其中包括省部共建教育部重点实验室1个、省部共建教育部工程研究中心1个、卫生部研究中心1个、卫生部重点实验室1个、浙江省重点实验室7个。拥有国家临床重点专科2个，浙江省“重中之重”重点学科一级学科1个、二级学科18个，浙江省高校重点学科12个（其中2个已经建成），浙江省医学重点学科群1个，浙江省医学重点学科已经建成了15个、建设的13个（其中省医学支撑学科8个、省医学创新学科5个）。
学校有32个本科专业和1个七年制本硕连读专业，涉及医学、理学、工学、管理学、文学、法学、教育学等七大学科门类。有全日制在校生15200余人（不含独立学院——温州医科大学仁济学院），其中博士研究生近100人，硕士研究生2600余人，学历教育留学生620余人。学校已形成从本科生到硕士生、博士生及博士后，从全日制到成人教育、留学生和港澳台学生教育全方位、多层次的人才培养体系。
学校有教职员工及医护人员9300余人（含各直属附属医院），其中具有高级专业技术职务1400余人。学校本部有专任教师1319人（不含独立学院），其中具有正高级专业技术职务298人，具有副高级专业技术职务360人。有研究生导师983人，其中博士生导师112人。拥有临床医学一级学科教授评审权和10个一级学科副教授评审权。一批优秀教师入选国家“千人计划”、“长江学者奖励计划”、国家“百千万人才工程”、教育部“新世纪优秀人才支持计划”、浙江省特级专家、省“千人计划”、省高校特聘教授、省“151人才工程”、省有突出贡献的中青年科技人员、省高校中青年学科带头人。