始建于2004年。烟台大学为解决学生住宿问题，在距烟台大学北校南六公里处而建。南校位于烟台港城东大街100号，对面就是烟台国际博览中心，西临滨州医学院烟台校区和烟台市体育公园，西北方向还有逛荡河，环境较好。南校区内主要有学生第十餐厅，宿舍楼7、8、9、10号，以及烟台大学工程实训中心焊接和铸造部。先前在此住宿的是大一男生女生和大二男生，其中大二女生在大一结束的时候就会搬到北校区。自2013年暑假结束以后，南校区的布局将发生重大改进，首先为了迎接更多的新生的到来，原先五个人的宿舍将会在原先的基础上加床改造，变成六人间。而整体的学生结构会变成大一全体，大二男生，大二文科女生。
南校交通南北校之间有109路公交车，自2010年以来，新增23路、567路、51路公交车，出行越来越便捷，极大的方便了南校区的师生。烟台大学南校站的乘车路线：17路 。首站末站：火车站-烟台大学南校。上行各站站名：火车站-港务局-口腔病医院-烟台日报社-朝阳街-烟台山医院-张裕博物馆-虹口宾馆-第一海水浴场-滨海假日酒店-月亮湾-栈桥-金龙桥-海滨住宅小区-财会培训中心-第二海水浴场-海天名人广场-莱山区政府-万光观海花园(迟家)-英杰学校-石沟屯-金海岸花园-黄海城市花园-山东工商学院-清泉寨-烟台大学-烟台大学南门-烟台清泉学校-体育公园-孙家滩-滨州医学院-烟台大学南校下行各站站名：烟台大学南校-滨州医学院-孙家滩-体育公园-烟台清泉学校-烟台大学南门-烟台大学-清泉寨-山东工商学院-黄海城市花园-金海岸花园-石沟屯-英杰学校-万光观海花园(迟家)-莱山区政府-海天名人广场-第二海水浴场-财会培训中心-海滨住宅小区-金龙桥-栈桥-月亮湾-滨海假日酒店-第一海水浴场-虹口宾馆-张裕博物馆-烟台山医院-朝阳街-烟台日报社-口腔病医院-港务局-火车站
烟台市特意增加的学生公交线路109路，路线为：烟台大学文经学院---烟台大学南校---烟台大学南门---烟台大学西门。票价五角，行驶时间大约为10分钟。