学院已建有药理学、细胞与分子生物学、药物分析与检测、制药工艺学、药物合成及仿制等十余个专业实验室，总面积达到1700平方米，实验仪器设备总资产达2000多万元。学院与大丰市政府联合共建江苏海洋药物开发协同创新中心平台，平台集教学、科研、实训、成果转化与社会服务为一体，高起点、高效率服务国家沿海开发战略和学校转型发展。
学院科研成果显著。学院教师近几年主持国家自然科学基金科研项目6项，在国内外学术期刊上发表论文200多篇，其中40多篇被SCI等国际权威检索工具收录，获取专利20多项。药学院高度重视学生的实践能力培养，初步构建起了“学习—实践—就业”一体化的人才培养体系，近几年两个专业的毕业生考研录取率一直位居全校前列。
专业介绍生物制药本专业培养具备较系统的生物制药基本理论、基础知识和基本技能，能在科研机构从事科学研究，能在企事业单位和行政管理部门从事与生物制药有关的应用研究、技术开发、生产、管理等工作的高级专门人才。
主要开设课程有生物化学、微生物学、细胞生物学、分子生物学、基因和蛋白质工程、药物化学、药物分析、药理学、药剂学、生物技术制药概论等专业必修课程，生物制药工艺学、制药设备与车间设计、药事管理与法规等专业选修课程。
制药工程本专业培养具有化学、药学和工程学科学基础、制药工程专业知识和从事药品及其他化学品技术开发和工程设计能力，能在医药、农药、精细化工和生物化工等部门从事医药产品的生产、科技开发、应用研究和经营管理等方面的高级工程技术人才。
主要开设有无机及分析化学、有机化学、物理化学、化工原理、生物化学、制药工程、药物化学、药理学、药剂学、药物分析及其相关课程实验等专业必修课程，药用生物学、免疫学、应用光谱学、精细化学品化学、化工仪表和自动化等专业选修课，药物合成反应、药物分离技术、天然药物化学、制药工艺学、制药设备及工艺设计、生化分离工程等方向课程。
学院领导党总支书记 沈克非
院长 王伯初（特聘）
副院长 赵庆新
党总支副书记、副院长刘洋