基础数学专业从1978年开始招收研究生，是国务院1981年首批批准具有硕士学位授予权的专业，并于1993年获博士学位授予权。计算数学、运筹学与控制论、应用数学等专业分别于1995年、1998年、2003年获硕士学位授予权，2006年数学学科成为硕士学位授权一级学科。2010年在国务院学位委员会第十一批学位点授权审核中，批准数学学科为一级学科博士学位授权点。与此同时，五个数学学科二级博士点（基础数学、应用数学、计算数学、运筹与控制论、概率论与数理统计）全面启动。2011年国务院学位委员会调整一级学科点，统计学作为独立的一级学科，同年国务院学位委员批准郑州大学统计学学科调整为一级硕士学位授权点。1998年经人事部批准设立数学博士后科研流动站。1988年基础数学成为河南省首批重点学科，以后连年保持。 2000年起计算数学是获得资助的省重点学科。2008年运筹学与控制论被评为河南省重点学科。2008年至今数学学科是河南省一级重点学科。
研究领域本学科目前的研究领域已涵盖数学的全部二级学科专业。特别在孤立子与可积系统、组合数学与最优化、有限元方法、控制理论与动力系统、微分几何与微分方程等一系列优势学科方向上，取得了系统的、有重要影响的科研成果，涌现出一批在国内外有较高知名度和学术影响力的学科带头人。这些优势学科方向中，某些研究方向在国内处于领先地位并达到国际领先水平。2009年以来，本学科主持国家自然科学基金、国家973计划资助项目和国家自然科学基金重点项目等共34项；主持省杰出人才计划、省创新人才培养工程基金、省杰出青年基金、高等学校博士点基金等省部级基金项目25项。
历史沿革郑州大学建立于1956年8月。数学、物理、化学是最初设立的三个系。
1954年河南省省会从开封迁到郑州。同年，经过院系调整之后，教育部决定在郑州市建立一所综合性大学，由各部属院校支援，并由山东大学负责筹建。建校时期的干部和教师大部分来自山东大学。最早来郑州选址征地的人员中有董树德，开学后任数学系代理系主任。数学系第一任党支部书记丁树勋来自东北财经学院。
1956至1966年是十年草创时期。建系之初，从北京大学、复旦大学、吉林大学、山东大学、武汉大学调来一批教师，如从北大调来吴祖基、裘光明等。前两届学生面向全国招生，采用翻译苏联的教材，学俄语。1958年郑大由“部属”变为“省管”，主要在省内招生。1962年郑州师院数学系并入。1963年郑州工学院基础部分出。1965年师生军训，参加农村“四清”运动。
1966年6月文化大革命爆发，停止招生，开始十年动乱时期。1969年1月至7月，全校师生到西平县二郎公社“接受贫下中农再教育”，数学系到焦店村。同年11月，作为“战备疏散”，全校搬迁到郾城县新店公社，数学系作为七连分散在几处搞运动。70年7月最后一届学生分配工作。71年2月郑大搬迁回郑州。1972年开始招收三年制推荐学员。1976年文革结束。