为了拓展办学空间，引进人才，加强对外交流，遵义医学院于2001年与珠海市政府正式签约设立遵义医学院校区。校区于2002年夏季落成并投入使用，是目前珠海市唯一的一所全国统招的医学本科院校。
十年来，在珠海市各级政府的大力支持下，校区在教学、科研、人才引进、学生就业、对外合作交流等方面都取得了长足的进展，得到社会的广泛认可。
校区基本情况校区占地面积774849.65㎡(可建筑用地面积约为占地面积的30%)，建筑面积119002㎡，其中教学行政用房面积92369㎡，其它用房面积25033㎡，各类运动场地约26420㎡，园林绿化面积542394.48㎡。
校区现有教职工564人，其中教授46人(二级教授2人，三级教授3人)，副教授134人，享受政府特殊津贴3人，硕士生导师72人。在校学生由当初与珠海市约定3000的办学规模发展为现在的6000余人，正健康、稳妥的向贵州省教育厅规划的7500人规模有序推进。
办学定位层次定位：以本科生教育为主体，积极发展研究生教育。
教育形式定位：以学历教育为主，举办各种形式的培训为辅，不搞教育产业化。
学科定位：医、药学科为主，积极创办为地方经济建设、社会发展需求的新学科和专业。不断拓展产、学、研，为地方经济服务。加强与国内、港澳台及海外院校合作办学，增强学校综合实力和拓展学生就业渠道。
教育理念：培养学生高度的社会责任感、面向世界的远大理想、扎实的实用型技能和理论知识，打造一流的校风和学风。
学科设置和专业结构目前，本科开设有临床医学、临床医学(妇产科学)、口腔医学、护理学、医学影像学、生物工程、英语(英语教育)、商务英语、社会体育指导与管理、药物制剂十个专业及方向。
研究生教育有5个一级学科授权点，包括基础医学、临床医学、口腔医学、药学、护理学类科学学位和专业学位，二级学科授权点37个，涵盖54个学科，面向全国包括港、澳、台地区招生。建有各类教学实习基地30多家，可供学生见习、实习。办学至今，已向珠海市、广东省以及全国各地输送毕业生近7000人。
科研水平建校以来，校区教师获得各级各类科研立项272项，获得资助经费926万元。其中获得国家基金委自然科学基金项目11项，省部级科研立项99项，地厅市级科研立项69项，区级科研立项1项，校级基金启动项目77项，校区科研启动项目15项，在国内外发表论文750余篇。
合作交流校区利用较好的区位优势，加强对外交流与合作。与澳门镜湖护理学院、澳门科技大学和香港公开大学合作培养医学人才，连续几年定期与澳门镜湖护理学院就护理学专业开展学科交流，澳门科技大学和香港公开大学学生的解剖课程几年都在珠海校区上课。与美国乌尔苏拉学院签署合作办学协议，目前还在进展当中。并加强与地方企业(如联邦制药、丽珠得乐、亿邦制药、贝索公司等)的联系，开展产、学、研合作，服务地方经济，扩大校区影响，发挥专业优势。