南通大学杏林学院是经国家教育部批准成立的本科层次独立学院。学院前身为南通医学院杏林学院，始建于1999年2月；2004年5月，在南通医学院、南通工学院和南通师范学院三院合并组建南通大学后，更名为南通大学杏林学院。
学院坐落于“中国近代第一城”、中国第一批沿海开放城市之一的江苏省南通市，以南通大学钟秀校区作为办学校园，占地面积近500亩。设有44个专业，涵盖经济学、文学、理学、工学、医学、管理学和艺术学等七大学科门类，现有全日制在校本科生一万余人。校园环境幽雅，人文氛围浓郁，教学、生活设施完善，是青年学子理想的求学成才之所。
学院依托南通大学实力雄厚的师资队伍，共享母体优质的教育教学资源，坚持“以育人为根本，以教学为中心”的办学理念，围绕“提升质量、凸显特色、创出品牌”的总体目标，实施“教学质量工程”、“名师培养工程”、“辅导员专家化工程”和“大学生素质拓展工程”，充分挖掘学院、社会及家长三方的优势资源，精心培育具有必要的理论基础、较强的实践能力、明显的技能优势的应用型人才。
近年来，学院深化改革，求真务实，开拓创新，充分发挥办学机制的灵活性，形成了健全的教育教学管理体系，为经济社会发展提供了有力的人才支持、智力支撑和知识贡献，在教育教学、思政党建、学生管理等各方面均取得显著成绩，形成了科学的办学管理机制：
科学的培养方案—根据培养应用型人才的目标，制定了适合我院学生的培养计划和课程体系。采取“因材施教，科学管理”的教学管理策略，重视学生综合素质的培养，尊重学生的个性，发挥学生的特长，挖掘学生的潜能，积极有效地为每一个杏林学子成才创造条件。
高效的管理机制—学院管理体系完整，运行机制灵活，拥有一支精干高效的管理队伍。建立健全了一系列以人为本、科学有效的行政、教学和学生管理制度，同时构建了学生自我教育、自我管理、自我服务的网络。
完善的助学体系—建立了由奖助学金、国家助学贷款、勤工助学、特困补助等构成的助学保障体系。设有学生工作指导委员会、家长委员会，实现家校共育。帮助学生配备人文科学素养和就业创业指导老师，指导学生建立各种各样的学习合作小组、科技创新小组、兴趣爱好小组、创业工作室等，形成了具有特色的助学成才体系。
